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图像查重 | 这篇文章因为Pubpeer上的质疑而撤稿了

Robin — Thu, 08 Dec 2022 05:40:30 +0000

近年来，论文评审网站Pubpeer.com 逐渐成为事实上的学术打假基地。图片问题一直是Pubpeer上的关注重点。那么，对图片的质疑会带来什么影响吗？

本期要讲解的论文“Diverse signaling pathways through the SDF-1/CXCR4 chemokine axis in prostate cancer cell lines leads to altered patterns of cytokine secretion and angiogenesis”就是因为Elisabeth Bik博士在PubPeer上质疑了其中的图片重复问题，然后作者选择了撤稿^[1]。

我们先观察文中的一组蛋白质电泳图。

图片：来自撤稿论文 Fig 6A^[2]

4h和24h的ERK1/2 面板看起来非常相似。但是电泳图的条带形状相似，想要快速辨别出来并非易事。这时，就可以借助ImaChek来筛查图片相似性。

完全重复的电泳图还是比较容易发现，那么在Fig 1B中，你能发现相似处吗？

图片：来自撤稿论文 Fig 1B^[2]

好像看不出来哪里存在重复，那么ImaChek能找到吗？

ImaChek初筛结果显示，LNCaP C4-2B-control面板中两张图和LNCaP C4-2B-CXCR4-Si面板的两张图片有相似。

通过ImaChek的手动分析工具，适当调整其中一张图的大小、亮度和对比度后，可以进一步确认图片重复的位置。现在，我们可以看到，LNCaP C4-2B-control 面板和LNCaP C4-2B-CXCR4-Si面板存在重叠区域。

虽然该文作者没有在Pubpeer上作出回应，但是在撤稿声明中注明了通讯作者选择撤稿是由于Bik博士指出了包括Fig 1B和Fig 6A在内的图片重复问题。

Pubpeer作为出版后的同行评议网站，逐渐成为“图片打假”平台，也是因为越来越多的专家们关注到了图片问题，所以自查图片也会成为学术诚信中的重要环节。

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参考资料：

[1] https://retractionwatch.com/2022/09/26/dental-school-dean-up-to-five-retractions-for-cancer-research-papers/

[2] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33454172/

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因为图片问题，诺奖得主撤回4篇PNAS论文！

Robin — Mon, 14 Nov 2022 08:12:55 +0000

2019年诺贝尔医学或生理学奖得主之一Gregg Semenza于9月初撤回了4篇PNAS论文，均是因为这些文中出现了图片问题^[1]。

本期案例分析，我们来看看其中一篇撤稿论文“Hypoxia-inducible factors are required for chemotherapy resistance of breast cancer stem cells”的图片问题^[2]。

有人指出该文中图3E的Pac + IL8 nAb和图5F的Vehicle可能存在数据相似性。

我们将撤稿论文中的图3E和图5F放在一起比对。

图3E和5F（局部）来自撤稿论文^[2]

的确能看出图3E和5F中存在相似图片。

但是，图3E和图5F出现在论文不同的页面上，想要发现这个问题就需要来回翻阅文章并比对图片。也许这是图片重复使用未能在出版前被及时发现的原因之一。

借助ImaChek，可以更快速地识别到文章中不同位置的相似图像，省去来回翻阅文章的步骤。

另一组图片重复出现在图6C和8A中。这类图片的外观很相似或又有不同，难以分辨。

ImaChek系统提取并检测出了相似的图片。

图6C和8A来自撤稿论文^[2]

但是被标记出的图片看上去并不一样，这两张图真的存在重复吗？

在ImaChek手动分析界面将一张图片拉伸后，再和另一张图片重叠，这时，图8A MDA-231 Actin的第2-5条带和图6C中SUM-159 Actin的条带能完全重复。

除了正文中的图片问题外，补充材料中的图片问题也不容忽视，比如：撤稿论文中的S5、S6中存在图片重复问题，也可通过ImaChek筛查出。

图S5A来自撤稿论文^[2]

图S6C和S6E来自撤稿论文^[2]

作者表示，上述图片问题源于在构建数据过程中选择了错误图像，并因为这些图片引起的担忧而选择撤稿。如此说来，为了个人的学术声誉，在投稿前自查文内图片也是重要环节。

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资料：

[1]https://retractionwatch.com/2022/09/03/nobel-prize-winner-gregg-semenza-retracts-four-papers/#more-125592

[2]https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.2213289119

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图像查重 | 科研不端案件中的图片问题（3）

Robin — Thu, 18 Aug 2022 02:56:11 +0000

在因图片问题被撤稿的论文中，有一种是比较难被发现的：图片之间只有部分或是很小部分的重复。

论文“Monocrotophos Induces the Expression and Activity of Xenobiotic Metabolizing Enzymes in Pre-Sensitized Cultured Human Brain Cells”中存在图像复用的情况，已被撤稿。

我们先来观察这篇论文中的Fig 2C细胞划痕实验图。

图片：Fig 2C

乍一看，感觉图片都不太一样。

我们通过ImaChek初筛后，可以得到以下结果。

当有读者提出这些图片存在重复时，作者表示是因为收集的图像过多，而导致图像出现误用。

如果说上述图片太多，隐藏在其中的重复不易被发现，那么图片少的时候，我们能否看出问题呢？

再来观察以下Fig D的3张图片。您能发现哪里有重复吗？

图片：Fig 2D

我们将图片传到ImaChek，找出以下结果。

左右滑动，查看图片比对情况

是的，这3张图片中出现了两两重复的情况。

我们通过观察还是可以比较快地发现大面积重叠的部分。但是，红色框出的边缘部分是不是很容易被忽略？

如果初筛结果不是很明显，那么使用标记功能，我们可以很容易看到相似特征点的排布位置，也就是两图的重复区域。即使是少量重叠的边缘区域也能被发现。

当图片的色彩有差异时，也可能会让我们忽略一些相似问题。我们可以比对下面两组图片：

图片：Fig 2D & 2F

Fig D和Fig F 两组图中的图片看上去有很大的差异，所以，仅通过肉眼好像不太容易识别出他们之间有相似的地方。

ImaChek可以给我们一个初筛结果。

即使有了以上初筛结果，是不是仍然很难发现具体重复的位置？通过标记相似特征，这两幅图的确存在重叠部分。

当期刊确定了这些图中存在重复的证据后，该文已被撤稿。

参考：

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2162253122001172

图像查重 | 科研不端案件中的图片问题（2）

Robin — Fri, 08 Jul 2022 02:11:04 +0000

科学论文中的文字抄袭剽窃有不同的形式，图片问题也是不同的。

论文“Monocrotophos Induces the Expression and Activity of Xenobiotic Metabolizing Enzymes in Pre-Sensitized Cultured Human Brain Cells”就因为多个图片问题已被撤稿。

我们来观察该篇撤稿论文中Fig 4的几组蛋白质电泳图，有没有发现什么问题？

图片来自已撤稿论文：Fig 4 A-D

比较容易发现的是以下两组图像完全重复。

而借助工具ImaChek系统来筛查图片，我们还可以发现图片中的局部重复。

例如Fig 4D中存在两个不同面板中的部分条带重复的情况。

这两张图看着还是有差别对吗？长度似乎不一样。

当我们适当调整图片比例，将其中一张图拉长些许后，两图的部分条带可以完全重叠。ImaChek系统提供多种工具，以便检查者对图片进行更细致地研判。

此外，该论文中的细胞染色图，例如Fig 5B，也存在多处相似的情况。

图片来自已撤稿论文：Fig 5B

图片相近的颜色和不同的曝光度是不是增加了肉眼识别的难度？

借助ImaChek的筛查，我们可以发现Fig 5B中就存在3处相似。相邻的图片、间隔的图片，或者跨行的图片都可能出现重复问题。

向右滑动，查看ImaChek筛查结果，点击图片可放大

是不是觉得相似图片的局部细节仍然有些区别？

通过ImaChek标记出图片的相似特征点，查看特征点排布情况可以辨别图片的相似性。

向右滑动，查看图片比对情况，点击图片可放大

作者对部分图片重复问题解释为图片准备过程中的错误，并提供了替换图片。但部分图片的原始数据已不可查。鉴于对已发表研究结果的完整性产生怀疑，PLOS ONE 编辑撤回了这篇文章。

参考：

https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0214164

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科研不端案件中的图片问题

Robin — Thu, 30 Jun 2022 02:02:24 +0000

医学论文中，图片是实验结果的再现，包含信息量大，阅读论文首先关注的就是图片。但近年来，因图片问题而产生的撤稿频发。今年5月份国家自然科学基金委员会通报的10起不端案件有8个涉及了图片问题，包括图片重复使用、图片不当操作、图片造假^[1]。

与成熟的文字重复/抄袭检测工具不同，图片检测目前还主要依靠肉眼识别分辨，费时费力，且难以避免错误。自动化检测工具的应用势在必行。

ImaChek，一款自动图像检测系统，针对科学研究中的图像问题而研发。使用ImaChek有助于简化图像筛选过程。

论文“AIB1 Cooperates with ERα to Promote Epithelial Mesenchymal Transition in Breast Cancer through SNAI1 Activation”是本次通报的10起不端案件中所涉及的论文。使用ImaChek对该文图片进行了筛查，以下列出部分检测结果。

图片：已撤稿论文^[2] Fig 7A

即使明显相似的图片，当混在一组图片里，仅凭肉眼也难以识别。借助ImaChek系统则很容易发现这类问题。

如果图片重复使用的位置在论文的不同页面，又或者当图片是经过了修改操作，更是加大了我们肉眼比对和识别相似性的难度。

根据撤稿声明，以下两组图片中有重复使用的图片。即便放在一起比对了，是不是仍然不容易发现究竟哪里出了问题？

图片：已撤稿论文^[2] Fig 1A和6C

ImaChek系统提取并检测出了相似的图片。但是这两张图看起来好像不太一样？？

在ImaChek系统中，我们可以对图片进行适当操作。

我们将其中一张图片旋转180°后，可以发现两张图是完全一致的。

如果说完全重复的图片还比较容易查找，那么图片存在局部相似的时候，是不是更需要花费时间来判别！

图片：已撤稿论文^[2] Fig 1F

根据撤稿说明，这组图片存在问题。ImaChek也检测到了相似。

似乎还是不太清楚？可以使用特征点功能标记出局部相似的位置。

：在“重叠”模式下，可以将这两张图完全拼接起来。

该论文因为存在多图相似、重叠和重复，使得文中数据的完整可靠性存疑，且作者表示原始数据已不可得，已被撤稿。

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参考：

[1] https://www.nsfc.gov.cn/publish/portal0/jd/04/info85497.htm

[2] https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0065556